地球最後の秘境とも言われるブラジル・アマゾン。世界最大級の大自然がある一方、環境破壊が進み、その姿は大きく変わり始めている。その生物多様性を守る為、日本の科学技術と学術研究によって、「フィールドミュージアム構想」という、アマゾンの大自然をブラジルの子どもたちと人類に残すための取り組みが始まろうとしている。 この番組は、魚のエキスパートである・さかなクンが、ブラジルで、絶滅危惧種のマナティの保護施設訪問や巨大魚釣り、日本の養殖技術で蘇ったピラルクの魚食体験などを通じて「アマゾンの今」を紹介する。